Protein–RNA interactions for Protein: Q1HDU4

Arhgap9, ArhGAP9, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap9Q1HDU4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Arhgap9Q1HDU4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms