Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Kcnma1Q08460 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Kcnma1Q08460 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Kcnma1Q08460 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Kcnma1Q08460 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Kcnma1Q08460 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Kcnma1Q08460 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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