Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms