Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cntn3Q07409 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cntn3Q07409 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cntn3Q07409 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cntn3Q07409 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cntn3Q07409 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Cntn3Q07409 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Cntn3Q07409 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cntn3Q07409 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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