Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms