Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NfiaQ02780 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms