Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ascl1Q02067 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ascl1Q02067 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms