Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Hoxd1Q01822 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Hoxd1Q01822 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms