Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col1a2Q01149 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms