Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smarcc1P97496 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms