Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme1P97371 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme1P97371 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme1P97371 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme1P97371 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme1P97371 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme1P97371 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms