Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ldb1P70662 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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