Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Usp9xP70398 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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