Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxd13P70217 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxd13P70217 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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