Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhobP62746 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhobP62746 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhobP62746 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhobP62746 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhobP62746 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhobP62746 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhobP62746 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhobP62746 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhobP62746 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhobP62746 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhobP62746 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhobP62746 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhobP62746 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhobP62746 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhobP62746 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhobP62746 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhobP62746 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RhobP62746 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RhobP62746 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RhobP62746 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RhobP62746 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RhobP62746 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RhobP62746 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RhobP62746 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RhobP62746 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RhobP62746 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RhobP62746 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RhobP62746 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RhobP62746 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RhobP62746 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RhobP62746 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RhobP62746 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RhobP62746 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RhobP62746 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RhobP62746 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RhobP62746 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RhobP62746 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RhobP62746 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RhobP62746 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RhobP62746 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RhobP62746 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RhobP62746 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RhobP62746 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RhobP62746 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms