Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rhbdl3P58873 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rhbdl3P58873 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms