Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NcanP55066 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NcanP55066 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcanP55066 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcanP55066 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcanP55066 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcanP55066 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcanP55066 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NcanP55066 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NcanP55066 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NcanP55066 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcanP55066 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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NcanP55066 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcanP55066 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcanP55066 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NcanP55066 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcanP55066 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcanP55066 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcanP55066 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcanP55066 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcanP55066 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcanP55066 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NcanP55066 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NcanP55066 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NcanP55066 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NcanP55066 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NcanP55066 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NcanP55066 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NcanP55066 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NcanP55066 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NcanP55066 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NcanP55066 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NcanP55066 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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