Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PctpP53808 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PctpP53808 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PctpP53808 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PctpP53808 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PctpP53808 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PctpP53808 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PctpP53808 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PctpP53808 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PctpP53808 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PctpP53808 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PctpP53808 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PctpP53808 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
PctpP53808 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PctpP53808 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
PctpP53808 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PctpP53808 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PctpP53808 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PctpP53808 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms