Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprkP35822 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprkP35822 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprkP35822 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprkP35822 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprkP35822 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprkP35822 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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