Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxc11P31313 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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