Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Hoxd10P28359 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms