Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa5P28312 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defa5P28312 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Defa5P28312 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms