Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tgfb2P27090 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms