Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Ggta1P23336 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Ggta1P23336 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms