Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ms4a2P20490 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms