Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VimP20152 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VimP20152 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VimP20152 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VimP20152 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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