Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csn1s1P19228 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csn1s1P19228 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csn1s1P19228 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csn1s1P19228 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csn1s1P19228 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csn1s1P19228 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Csn1s1P19228 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csn1s1P19228 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csn1s1P19228 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csn1s1P19228 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csn1s1P19228 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csn1s1P19228 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csn1s1P19228 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Csn1s1P19228 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csn1s1P19228 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csn1s1P19228 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csn1s1P19228 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csn1s1P19228 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csn1s1P19228 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Csn1s1P19228 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csn1s1P19228 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms