Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P18528 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P18528 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms