Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpraP18052 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PtpraP18052 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpraP18052 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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PtpraP18052 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpraP18052 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpraP18052 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpraP18052 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpraP18052 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PtpraP18052 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms