Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SrgnP13609 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms