Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Vpreb2P13373 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms