Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
P10404 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
P10404 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P10404 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
P10404 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P10404 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
P10404 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P10404 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P10404 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
P10404 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P10404 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P10404 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P10404 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P10404 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P10404 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P10404 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P10404 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P10404 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P10404 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P10404 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P10404 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P10404 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
P10404 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
P10404 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms