Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Vmn1r37-202ENSMUST00000226311 1305 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxb4P10284 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms