Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl2P10148 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl2P10148 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms