Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
UbbP0CG49 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms