Protein–RNA interactions for Protein: P03980

Ig heavy chain V region TEPC 1017, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P03980 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P03980 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P03980 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P03980 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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