Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P01747 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P01747 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P01747 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P01747 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P01747 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P01747 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P01747 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P01747 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
P01747 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
P01747 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P01747 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
P01747 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P01747 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P01747 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
P01747 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
P01747 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P01747 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P01747 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P01747 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P01747 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
P01747 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P01747 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
P01747 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
P01747 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P01747 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
P01747 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01747 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01747 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01747 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01747 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01747 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01747 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01747 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01747 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
P01747 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01747 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01747 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01747 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01747 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01747 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01747 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01747 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01747 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01747 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01747 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01747 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01747 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
P01747 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms