Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2f6O54917 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2f6O54917 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
E2f6O54917 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms