Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Opn1mwO35599 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms