Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptch2O35595 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptch2O35595 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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