Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc27a2O35488 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms