Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm42964-201ENSMUST00000202965 382 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm35135-201ENSMUST00000219885 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ColqO35348 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Rd3l-204ENSMUST00000190536 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
ColqO35348 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms