Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ptpn9O35239 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ptpn9O35239 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ptpn9O35239 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ptpn9O35239 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ptpn9O35239 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ptpn9O35239 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ptpn9O35239 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ptpn9O35239 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ptpn9O35239 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ptpn9O35239 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ptpn9O35239 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ptpn9O35239 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ptpn9O35239 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ptpn9O35239 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ptpn9O35239 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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