Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Eftud2O08810 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Eftud2O08810 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms