Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ascl4M0QW46 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ascl4M0QW46 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms