Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm933J3QPC1 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm933J3QPC1 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms