Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Gm11236J3QMS7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gm11236J3QMS7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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Gm11236J3QMS7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm11236J3QMS7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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