Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn34c3J3QJW5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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