Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm20828J3KMI7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20828J3KMI7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms