Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmgcF6VRN1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmgcF6VRN1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SmgcF6VRN1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SmgcF6VRN1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmgcF6VRN1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmgcF6VRN1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmgcF6VRN1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmgcF6VRN1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmgcF6VRN1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmgcF6VRN1 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SmgcF6VRN1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SmgcF6VRN1 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SmgcF6VRN1 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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